Muso Shinden Ryu, kuten useimmat iaido-tyylisuunnat, juontaa juurensa suoraan iaidon perustajaan Hayashizaki Jinsuke Minamoto no Shigenobuun. Täyttäessään 21 Hayashizaki meni sadaksi päiväksi sintolaiseen temppeliin. Siellä ollessaan hän sai unessa näyn, jonka perusteella hän kehitti batto-tekniikat (tekniikka, jossa miekan veto tupesta muodostaa ensimmäisen lyönnin). Hän kutsui tyyliään Shimmei Muso Ryuksi. Tämä oli ensimmäinen systemaattinen puhdas iai-koulukunta.